Η ΓΣΕΕ βρίσκεται στο πλευρό του Προέδρου της Πανελλήνιας Ένωσης Ναυτών Εμπορικού Ναυτικού, ο οποίος διώκεται ποινικά επειδή άσκησε στην ουσία τα συνδικαλιστικά του καθήκοντα, κατά την απεργία που είχε κηρύξει η Συνομοσπονδία τον Ιούνιο του 2021.
Για τη ΓΣΕΕ, είναι πάγια και αδιαπραγμάτευτη η θέση της, ότι είναι απαράδεκτο να διώκεται η συνδικαλιστική δράση και μάλιστα σε μία νόμιμη απεργία της τριτοβάθμιας συνδικαλιστικής οργάνωσης της χώρας.
Οι συλλογικοί αγώνες των συνδικαλιστών, έχουν ξεκάθαρο στόχο την προάσπιση των δικαιωμάτων των εργαζομένων που εκπροσωπούν και σε καμία περίπτωση δεν πρέπει και δε μπορούν να κρίνονται στις δικαστικές αίθουσες.
